深圳市职业病防治院于2005年2月正式成立，深圳卫生和计划生育委员会直属单位，是集职业卫生技术服务、职业病防治、职业病诊断、放射防护、化学中毒与核辐射医疗救治、职业康复为一体的现代化职业病防治科、教、研公共卫生机构。
　　医院成立以来，实现了跨越式发展。开展的工作主要有职业病危害检测与评价、放射卫生防护检测与评价、职业健康监护、职业病诊断与治疗、职业康复、基本医疗服务。与香港中文大学公共卫生学院建立教育与科研合作单位、与广东药学院建立教学实习基地、与瑞士著名ReHa Clinic Bad Zurzach康复医院合作建立了“中瑞康复医疗中心”。医院中毒和职业病科荣为国家、省、市临床重点专科，开展了无痛麻醉下支气管肺泡灌洗治疗尘肺、乙酰半胱氨酸口服治疗尘肺、CD4+CD25+调节性T细胞在慢性苯中毒患者诊断中的应用等数十项新技术，在国内同行中处领先地位。医院还承担市科创委深圳市民生重点实验室—重大职业病诊疗技术实验室建设项目；建立了中国化学中毒医疗救治基地远程会诊中心深圳基地和深圳市化学中毒控制和咨询中心。医院多名专家被聘为国家卫计委和安监总局相关专业委员会副主任委员及委员职务，参与多项国家职业病防治法规、标准的编制和修订。